影片的具体片长已确认为1小时49分钟,《刺猬索尼克3》将围绕游戏中的故事情节展开。电影将重点讲述刺猬夏特（Shadow the Hedgehog）的故事，这一角色是由科学家杰拉尔德·罗博尼克（Gerald Robotnik）所创造。杰拉尔德是第一、第二部电影反派蛋头博士（Ivo Robotnik）的祖父。金·凯瑞将继续饰演蛋头博士，并在影片中也扮演杰拉尔德一角。